MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Beijing/NITR203

Total Repeats: 97973

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021054	CAC	2	6	27	32	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479312834
2	NC_021054	GTC	2	6	46	51	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479312834
3	NC_021054	GAC	2	6	79	84	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479312834
4	NC_021054	CAG	2	6	90	95	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479312834
5	NC_021054	TCG	2	6	167	172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479312834
6	NC_021054	AGC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479312834
7	NC_021054	GCC	2	6	260	265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479312834
8	NC_021054	CCG	2	6	304	309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479312834
9	NC_021054	CGAC	2	8	311	318	25 %	0 %	25 %	50 %	479312834
10	NC_021054	CGA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479312834
11	NC_021054	GCC	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479312834
12	NC_021054	ACG	2	6	389	394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479312834
13	NC_021054	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479312834
14	NC_021054	CGTT	2	8	527	534	0 %	50 %	25 %	25 %	479312834
15	NC_021054	CGC	3	9	561	569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479312834
16	NC_021054	CCCG	2	8	589	596	0 %	0 %	25 %	75 %	479312834
17	NC_021054	AC	3	6	643	648	50 %	0 %	0 %	50 %	479312834
18	NC_021054	GGCA	2	8	660	667	25 %	0 %	50 %	25 %	479312834
19	NC_021054	GTT	2	6	681	686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479312834
20	NC_021054	CGA	2	6	810	815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479312834
21	NC_021054	TTC	2	6	856	861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479312834
22	NC_021054	CAA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479312834
23	NC_021054	TCATC	2	10	902	911	20 %	40 %	0 %	40 %	479312834
24	NC_021054	CCCA	2	8	918	925	25 %	0 %	0 %	75 %	479312834
25	NC_021054	AGC	2	6	926	931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479312834
26	NC_021054	ACC	2	6	993	998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479312834
27	NC_021054	CGA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479312834
28	NC_021054	CAG	2	6	1086	1091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479312834
29	NC_021054	GC	3	6	1121	1126	0 %	0 %	50 %	50 %	479312834
30	NC_021054	GCG	2	6	1237	1242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479312834
31	NC_021054	CCG	2	6	1259	1264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479312834
32	NC_021054	CA	3	6	1408	1413	50 %	0 %	0 %	50 %	479312834
33	NC_021054	CAC	2	6	1491	1496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479312834
34	NC_021054	CGTTT	2	10	2091	2100	0 %	60 %	20 %	20 %	479312835
35	NC_021054	GTGG	2	8	2131	2138	0 %	25 %	75 %	0 %	479312835
36	NC_021054	GCCA	2	8	2149	2156	25 %	0 %	25 %	50 %	479312835
37	NC_021054	CGGTGC	2	12	2163	2174	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	479312835
38	NC_021054	GTT	2	6	2185	2190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479312835
39	NC_021054	CCG	2	6	2241	2246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479312835
40	NC_021054	TTG	2	6	2303	2308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479312835
41	NC_021054	CGA	2	6	2406	2411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479312835
42	NC_021054	TTG	2	6	2462	2467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479312835
43	NC_021054	ATT	2	6	2476	2481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479312835
44	NC_021054	TCAG	2	8	2493	2500	25 %	25 %	25 %	25 %	479312835
45	NC_021054	CGC	2	6	2509	2514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479312835
46	NC_021054	GAC	2	6	2522	2527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479312835
47	NC_021054	GGT	2	6	2575	2580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479312835
48	NC_021054	CGT	2	6	2634	2639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479312835
49	NC_021054	GCC	2	6	2690	2695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479312835
50	NC_021054	CGG	2	6	2707	2712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479312835
51	NC_021054	CGTT	2	8	2719	2726	0 %	50 %	25 %	25 %	479312835
52	NC_021054	GCA	2	6	2793	2798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479312835
53	NC_021054	CTT	2	6	2807	2812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479312835
54	NC_021054	AC	3	6	2854	2859	50 %	0 %	0 %	50 %	479312835
55	NC_021054	CCA	2	6	2868	2873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479312835
56	NC_021054	GC	3	6	2931	2936	0 %	0 %	50 %	50 %	479312835
57	NC_021054	GAT	2	6	2987	2992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479312835
58	NC_021054	TTG	3	9	3015	3023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479312835
59	NC_021054	ACGG	2	8	3071	3078	25 %	0 %	50 %	25 %	479312835
60	NC_021054	GCCT	2	8	3133	3140	0 %	25 %	25 %	50 %	479312835
61	NC_021054	CGG	2	6	3204	3209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479312835
62	NC_021054	CGGTT	2	10	3240	3249	0 %	40 %	40 %	20 %	479312835
63	NC_021054	CGTC	2	8	3284	3291	0 %	25 %	25 %	50 %	479312836
64	NC_021054	TTG	2	6	3361	3366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479312836
65	NC_021054	CGA	2	6	3415	3420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479312836
66	NC_021054	GGTA	2	8	3464	3471	25 %	25 %	50 %	0 %	479312836
67	NC_021054	GTG	2	6	3498	3503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479312836
68	NC_021054	ACG	2	6	3505	3510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479312836
69	NC_021054	CAA	2	6	3554	3559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479312836
70	NC_021054	ATC	2	6	3575	3580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479312836
71	NC_021054	TGT	2	6	3622	3627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479312836
72	NC_021054	GGTT	2	8	3646	3653	0 %	50 %	50 %	0 %	479312836
73	NC_021054	CGG	2	6	3672	3677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479312836
74	NC_021054	GAT	2	6	3687	3692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479312836
75	NC_021054	GT	3	6	3811	3816	0 %	50 %	50 %	0 %	479312836
76	NC_021054	TGG	2	6	3868	3873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479312836
77	NC_021054	CCGC	2	8	3874	3881	0 %	0 %	25 %	75 %	479312836
78	NC_021054	GAA	2	6	3914	3919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479312836
79	NC_021054	AGC	2	6	4028	4033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479312836
80	NC_021054	GGC	2	6	4043	4048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479312836
81	NC_021054	GGC	2	6	4052	4057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479312836
82	NC_021054	GAC	2	6	4110	4115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479312836
83	NC_021054	GGC	2	6	4199	4204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479312836
84	NC_021054	TGG	2	6	4226	4231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479312836
85	NC_021054	GTT	2	6	4241	4246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479312836
86	NC_021054	CGA	2	6	4250	4255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479312836
87	NC_021054	CGG	2	6	4300	4305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479312836
88	NC_021054	CCG	2	6	4312	4317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479312836
89	NC_021054	CCG	2	6	4357	4362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479312836
90	NC_021054	GGT	2	6	4421	4426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479312836
91	NC_021054	TGC	3	9	4531	4539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479312837
92	NC_021054	CG	5	10	4541	4550	0 %	0 %	50 %	50 %	479312837
93	NC_021054	GTCGG	2	10	4588	4597	0 %	20 %	60 %	20 %	479312837
94	NC_021054	CGA	2	6	4610	4615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479312837
95	NC_021054	GGT	2	6	4744	4749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479312837
96	NC_021054	CCA	2	6	4753	4758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479312837
97	NC_021054	ACG	2	6	4791	4796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479312837
98	NC_021054	CGC	2	6	4876	4881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479312837
99	NC_021054	CGG	2	6	4926	4931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479312837
100	NC_021054	CG	3	6	4977	4982	0 %	0 %	50 %	50 %	479312837
101	NC_021054	AAG	2	6	5254	5259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479312838
102	NC_021054	GGT	2	6	5382	5387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479312838
103	NC_021054	CGA	2	6	5400	5405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479312838
104	NC_021054	TGC	2	6	5441	5446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479312838
105	NC_021054	CGA	2	6	5472	5477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479312838
106	NC_021054	CCAC	2	8	5498	5505	25 %	0 %	0 %	75 %	479312838
107	NC_021054	ACCG	2	8	5517	5524	25 %	0 %	25 %	50 %	479312838
108	NC_021054	GTG	2	6	5530	5535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479312838
109	NC_021054	CGG	2	6	5553	5558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479312838
110	NC_021054	TGG	2	6	5589	5594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479312838
111	NC_021054	CGGCGT	2	12	5601	5612	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	479312838
112	NC_021054	GGT	2	6	5616	5621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479312838
113	NC_021054	CAAG	2	8	5712	5719	50 %	0 %	25 %	25 %	479312838
114	NC_021054	AAG	2	6	5731	5736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479312838
115	NC_021054	CGCC	2	8	5808	5815	0 %	0 %	25 %	75 %	479312838
116	NC_021054	CAA	2	6	5838	5843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479312838
117	NC_021054	CGA	2	6	5865	5870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479312838
118	NC_021054	GTC	2	6	5890	5895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479312838
119	NC_021054	TGG	2	6	6008	6013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479312838
120	NC_021054	AGC	2	6	6055	6060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479312838
121	NC_021054	GGC	2	6	6175	6180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479312838
122	NC_021054	GC	3	6	6203	6208	0 %	0 %	50 %	50 %	479312838
123	NC_021054	GGT	2	6	6216	6221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479312838
124	NC_021054	AAGGAC	2	12	6253	6264	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	479312838
125	NC_021054	AGACCA	2	12	6347	6358	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	479312838
126	NC_021054	GCG	2	6	6519	6524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479312838
127	NC_021054	CGGC	2	8	6623	6630	0 %	0 %	50 %	50 %	479312838
128	NC_021054	ATC	2	6	6691	6696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479312838
129	NC_021054	GC	3	6	6709	6714	0 %	0 %	50 %	50 %	479312838
130	NC_021054	ATC	2	6	6751	6756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479312838
131	NC_021054	ACG	2	6	6779	6784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479312838
132	NC_021054	TGT	2	6	6866	6871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479312838
133	NC_021054	GTT	3	9	6876	6884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479312838
134	NC_021054	CCG	2	6	6934	6939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479312838
135	NC_021054	CTG	2	6	7006	7011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479312838
136	NC_021054	GAA	2	6	7032	7037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479312838
137	NC_021054	CAA	2	6	7041	7046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479312838
138	NC_021054	ACC	2	6	7108	7113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479312838
139	NC_021054	GT	3	6	7130	7135	0 %	50 %	50 %	0 %	479312838
140	NC_021054	GAC	2	6	7153	7158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479312838
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143	NC_021054	CG	3	6	7209	7214	0 %	0 %	50 %	50 %	479312838
144	NC_021054	GACA	2	8	7303	7310	50 %	0 %	25 %	25 %	479312839
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150	NC_021054	CG	3	6	7415	7420	0 %	0 %	50 %	50 %	479312839
151	NC_021054	CGGT	2	8	7523	7530	0 %	25 %	50 %	25 %	479312839
152	NC_021054	ACC	2	6	7551	7556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479312839
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243	NC_021054	GGT	2	6	12004	12009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479312843
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246	NC_021054	GAGC	2	8	12091	12098	25 %	0 %	50 %	25 %	479312843
247	NC_021054	GGC	2	6	12107	12112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479312843
248	NC_021054	CGG	2	6	12147	12152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479312843
249	NC_021054	GAG	2	6	12209	12214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479312843
250	NC_021054	CTCA	2	8	12302	12309	25 %	25 %	0 %	50 %	479312843
251	NC_021054	ACG	2	6	12663	12668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479312844
252	NC_021054	CGG	2	6	12736	12741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479312844
253	NC_021054	CGA	2	6	12760	12765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479312844
254	NC_021054	TCA	2	6	12849	12854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479312844
255	NC_021054	GGT	2	6	12985	12990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479312844
256	NC_021054	CAG	2	6	13222	13227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479312845
257	NC_021054	C	6	6	13228	13233	0 %	0 %	0 %	100 %	479312845
258	NC_021054	GGC	2	6	13266	13271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479312845
259	NC_021054	TCG	2	6	13286	13291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479312845
260	NC_021054	GAT	2	6	13297	13302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479312845
261	NC_021054	AACC	2	8	13337	13344	50 %	0 %	0 %	50 %	479312845
262	NC_021054	GC	3	6	13388	13393	0 %	0 %	50 %	50 %	479312845
263	NC_021054	CCCG	2	8	13446	13453	0 %	0 %	25 %	75 %	479312845
264	NC_021054	TGC	2	6	13550	13555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479312845
265	NC_021054	CAA	2	6	13734	13739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479312846
266	NC_021054	AAC	2	6	13885	13890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479312846
267	NC_021054	ACCTTC	2	12	13918	13929	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	479312846
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270	NC_021054	ACCC	2	8	14097	14104	25 %	0 %	0 %	75 %	479312848
271	NC_021054	GA	3	6	14125	14130	50 %	0 %	50 %	0 %	479312848
272	NC_021054	TGAT	2	8	14134	14141	25 %	50 %	25 %	0 %	479312848
273	NC_021054	GGCGT	2	10	14153	14162	0 %	20 %	60 %	20 %	479312848
274	NC_021054	TGCT	2	8	14181	14188	0 %	50 %	25 %	25 %	479312848
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276	NC_021054	GCC	2	6	14205	14210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479312848
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280	NC_021054	GGC	2	6	14375	14380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479312848
281	NC_021054	GCG	2	6	14387	14392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479312848
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283	NC_021054	GGGCC	2	10	14436	14445	0 %	0 %	60 %	40 %	479312848
284	NC_021054	TGG	2	6	14446	14451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479312848
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289	NC_021054	CGC	2	6	14684	14689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479312848
290	NC_021054	CGC	3	9	14699	14707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479312848
291	NC_021054	GCT	2	6	14715	14720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479312848
292	NC_021054	GAA	2	6	14787	14792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479312848
293	NC_021054	ACT	2	6	14869	14874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479312848
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295	NC_021054	ACC	2	6	15013	15018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479312849
296	NC_021054	GCC	2	6	15033	15038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479312849
297	NC_021054	GC	3	6	15092	15097	0 %	0 %	50 %	50 %	479312849
298	NC_021054	GCA	2	6	15132	15137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479312849
299	NC_021054	CA	3	6	15136	15141	50 %	0 %	0 %	50 %	479312849
300	NC_021054	GCGTT	2	10	15181	15190	0 %	40 %	40 %	20 %	479312849
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374	NC_021054	GCCG	2	8	18425	18432	0 %	0 %	50 %	50 %	479312851
375	NC_021054	GGT	2	6	18567	18572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479312851
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383	NC_021054	TTAGC	2	10	19036	19045	20 %	40 %	20 %	20 %	479312852
384	NC_021054	CG	3	6	19064	19069	0 %	0 %	50 %	50 %	479312852
385	NC_021054	GCT	2	6	19072	19077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479312852
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387	NC_021054	GGTCC	2	10	19108	19117	0 %	20 %	40 %	40 %	479312852
388	NC_021054	GCC	2	6	19154	19159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479312852
389	NC_021054	GCG	2	6	19242	19247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479312852
390	NC_021054	CG	4	8	19322	19329	0 %	0 %	50 %	50 %	479312852
391	NC_021054	TGC	2	6	19333	19338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479312852
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393	NC_021054	TGC	2	6	19471	19476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479312852
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497	NC_021054	GTG	2	6	23951	23956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479312856
498	NC_021054	TGG	2	6	23961	23966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479312856
499	NC_021054	AC	3	6	24027	24032	50 %	0 %	0 %	50 %	479312856
500	NC_021054	GAT	2	6	24073	24078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479312856

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